棟札（むなふだ）によると、現在の本殿（ほんでん）は元文5年（1740）5月に建立・正遷宮が行われた建物であり、大工は清沢村（現・高津区千年）の木嶋佐右衛門です。彼は影向寺（ようごうじ）薬師堂の大工棟梁木嶋長右衛門の次男で、木嶋家の名跡（みょうせき）を継いでいます。
　本殿は当初、独立して立っていましたが、18世紀末に本殿、幣殿（へいでん）、拝殿（はいでん）の形式を備えていたことが、寛政2年（1790）の境内絵図によって判明します。大正12年（1923）の関東大震災で拝殿と幣殿が倒壊し、本殿も被害を受けました。その後、昭和3年（1928）に拝殿と幣殿を再建しましたが、その際本殿の位 置を少し南に移し、本殿の基壇（きだん）を新たに築き、また、土台を加えたと考えられます。
　本殿は正面 柱間3間、側面2間、身舎（もや）の正面に庇（ひさし）を付けた形で、屋根は流造（ながれつくり）・銅板瓦棒葺（かわらぼうぶき）です。この本殿形式を間口が3間であることから、三間社（さんげんしゃ）流造といいます。市内に現存する江戸時代の神社本殿は一間社（いっけんしゃ）がほとんどで、三間社は当社が唯一の遺例です。三間社流造の本殿は正面 に戸口を一つ開き、他を板壁として内部を一室にするのが古式ですが、この本殿は身舎を内陣（ないじん）と外陣（げじん）に分けて、内陣の床を高く造り、内陣と外陣の正面 柱間各3間に板扉を立てています。これは山王大権現三座を祭ることに関係するのでしょう。

　流造本殿の意匠の重点は妻側の構成と正面 向拝（ごはい）にありますが、この本殿もそこに時代の特徴が認められます。身舎の組物（くみもの）は出組斗（でぐみときょう）で、組物間に三猿などの動物を彫り出した蟇股（かえるまた）を置き、板支輪（いたしりん）に雲紋彫刻を施しています。妻飾（つまかざり）は二重虹梁（こうりょう）を大瓶束（たいへいつか）で受け、豕扠首（いのこさす）にて棟木（むなき）を支えます。また、虹梁間に背丈の高い彫刻付の蟇股を置き、外観はたいへん華やかです。向拝は中央の柱間を広くして、組物の間に龍の彫刻を置くなど、新趣向が見られます。なお、向拝の両側はもと建具がなく開放であり、また、正面 に浜縁（はまえん）が付いていました。本殿（附　棟札1枚・山王社境内絵図1枚）は、平成2年（1990）に市重要歴史記念物に指定されました。

本殿平面図